外泌體和非編碼RNA都是當(dāng)下熱門的研究領(lǐng)域，并且非編碼RNA廣泛存在與外泌體，也可以通過(guò)外泌體發(fā)揮生物學(xué)功能。外泌體是由細(xì)胞分泌的一種直徑在30-150nm之間的囊泡，含有不同種類的RNA，可以調(diào)節(jié)受體細(xì)胞的行為，并且可以作為疾病的循環(huán)生物標(biāo)記物，在血液，唾液，尿液等多種體液中都廣泛存在。

    今天我們介紹一個(gè)人類血液外泌體circRNA、lncRNA和mRNA的數(shù)據(jù)庫(kù)exoRBase（http://www.exorbase.org/）。該數(shù)據(jù)庫(kù)收集了七個(gè)實(shí)驗(yàn)的92個(gè)RNAseq樣品信息，共有58330個(gè)circRNA，15501lncRNA和18333個(gè)mRNA。數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的樣本包括健康對(duì)照者32例，冠狀動(dòng)脈心臟疾病（CHD）6例，結(jié)腸癌（CRC）12例，肝細(xì)胞癌（HCC）21例，胰腺腺癌（PAAD）14例，乳腺癌2例。該數(shù)據(jù)相關(guān)文章發(fā)表在Nucleic Acids Research（IF=11.501）期刊上。

    打開數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站會(huì)出現(xiàn)一個(gè)簡(jiǎn)潔的頁(yè)面，有一個(gè)搜索框，還有其他模塊瀏覽，下載，搜索等。

    我們?cè)囍阉饕幌拢阉鱇ARS，會(huì)出現(xiàn)基因的信息，包括基因類型，相關(guān)circRNA，表達(dá)豐度，組織特異性，樣本類型等。還會(huì)根據(jù)疾病組織表達(dá)情況繪制折線圖，熱圖或者箱型圖。

    相關(guān)circRNA點(diǎn)擊后會(huì)出現(xiàn)如下信息，包括基因組位置，表達(dá)豐度，樣本信息，在疾病中表達(dá)情況。也根據(jù)疾病組織表達(dá)情況繪制折線圖，熱圖或者箱型圖。

    瀏覽模塊分為兩部分，一部分是circRNA，另一部分是lncRNA和mRNA。我們以HCC為例檢索先關(guān)circRNA表達(dá)。

    lncRNA與mRNA瀏覽界面與circRNA相似。

    該數(shù)據(jù)庫(kù)還提供數(shù)據(jù)下載，有需要的可以自行下載。

    今天就到這，下回帶大家看點(diǎn)別的。