該數(shù)據(jù)庫使用 PCAWG 和 TCGA 的數(shù)據(jù)集評估了 12 種驅(qū)動(dòng)基因計(jì)算方法的性能后,將基因、相應(yīng)的可能性分?jǐn)?shù)和基因在候選驅(qū)動(dòng)基因列表中的基因排名通過 12 種計(jì)算方法使用 6 個(gè)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析。基因的等級越高,就越有可能成為真正的癌癥驅(qū)動(dòng)因素。http://159.226.67.237/sun/cancer_driver/
數(shù)據(jù)庫頁面非常簡潔,在主頁上進(jìn)行搜索、下載即可。
l Search
選擇癌癥類型、計(jì)算方法、網(wǎng)絡(luò)后,輸入感興趣的基因如“TP53”,點(diǎn)擊submit后將在下方顯示搜索結(jié)果。
點(diǎn)擊gene可以跳轉(zhuǎn)到該基因的NCBI頁面。搜索結(jié)果可以下載為excel或csv格式的文件。
l Download
數(shù)據(jù)庫提供以上3類數(shù)據(jù)的下載,點(diǎn)擊鏈接進(jìn)行保存即可。