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BLAB2CancerKD:乳酸菌與癌癥數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2023-08-30
該數據庫使用7794篇乳酸菌癌文獻作為源數據,處理了16543個生物醫學概念和23091個關聯......

       癌癥是一種某些細胞生長失控并擴散到身體其他部位的疾病,是全球人類死亡的主要原因之一。研究表明,乳酸菌(LAB)可以調節人體腸道菌群,提高胃腸功能和身體免疫力。近年來,LAB在癌癥治療中的潛力引起了人們的關注。
       該數據庫使用7794篇乳酸菌癌文獻作為源數據,處理了16543個生物醫學概念和23091個關聯。構建了一個包含31434條結構化數據的本體。BLAB2CancerKD以各種數據呈現形式直觀、清晰地呈現了所有相關知識,交互系統功能也使其更加高效。
       http://110.40.139.2:18095/

  • BLAB2CancerKG module 1 (adjustable category display)

       該模塊主要以數據顯示為主。用戶可以搜索“concept”或“association”來獲得KG,然后單擊標簽圖例來隱藏或顯示不同類別。該模塊支持csv、.JSON和.PNG格式的圖片導出。

  • BLAB2CancerKG module 2 (adjustable search object)

       用戶通過搜索獲得結果圖后,可以通過點擊“switch layout”按鈕在兩種不同的KG顯示形式之間切換,并支持.CSV格式的數據下載。


       此外,可以點擊一個節點,以該節點為中心節點查看KG,并同時提供谷歌搜索和NCBI搜索。

  • BLAB2CancerKG module 4 (focus on cancer)

       該模塊只顯示與癌癥相關的乳酸菌信息,提供了占最大比例的八個腫瘤類別的子圖。

  • BLAB2CancerKG Ontology Data Sheet

       該模塊以列表形式顯示所有BLAB2Cancer本體結構數據,提供搜索和數據導出功能,并提供PubMed鏈接用于可追溯性驗證。

  • Text annotation module

       本模塊包括所有與乳酸菌和癌癥相關的7794篇科學文獻摘要。用戶可以通過PMID或關鍵字搜索相應的文獻摘要。該模塊突出顯示了所有相關的生物醫學概念,當光標放在相應的實體概念上時,可以看到相應的類別和NCBI_ID。


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