Southern Blot是檢測基因組樣本中特定DNA序列的一種方法。主要原理是根據堿基互補配對原則，具有一定同源性的兩條核酸單鏈在適宜環境中可雜交形成雙鏈。通過凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的待檢DNA分子，轉移至尼龍膜或其他固相支撐物上，固定后與標記好的探針進行雜交，利用放射自顯影或酶反應顯色, 從而檢測特定DNA分子的含量。
Southern Blot實驗流程

1. 基因組提取:基因組要求完整性好,純度高

2. 基因組酶切

3. 電泳分離酶切好的DNA樣品: 20~40ug/泳道, 25-30V穩壓電泳12-24h。

4. 轉膜

5. 探針制備

6. 預雜交

7. 雜交

8. 檢測