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circRNA(環狀RNA)定量PCR

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circRNA(環狀RNA)定量PCR

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cirRNA熒光定量PCR實驗
    circRNA 是通過特殊的選擇性剪切產生封閉環狀結構的非編碼RNA。 circRNA不受RNA外切酶的影響,比線性RNA表達更穩定。研究表明,某些特殊的 circRNA 分子富含 miRNA結合位點,在細胞中起到miRNA sponges的作用,進而解除 miRNA 對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含 63 個保守的 miR-7結合位點,該 circRNA 在細胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7 作為關鍵調節因子廣泛參與癌癥途徑,如抑制在乳腺癌、膠質瘤等癌癥中表達顯著上調的Pak1的表達;miR-7 也能通過結合α-synuclein抑制其表達。這些研究暗示ciRS-7 通過ceRNA 機制調節miR-7的功能,是神經系統疾病和癌癥治療的潛在靶點。

      圖1 cirRNA轉錄過程                            圖2 ciRs-7作用機制
由于cirRNA特殊結構及其表達豐度低的原因,cirRNA定量PCR實驗還存在一定困難。本公司經過特殊的引物設計、反轉錄過程及PCR擴增過程的實驗條件優化,能夠高效定量檢測cirRNA的表達。
CirRNA定量PCR實驗流程如下:
1、樣品RNA抽提
2、RNA質檢
3、RNA逆轉錄cDNA
4、cirRNA特殊引物設計及其調試

圖3 cirRNA divergent 引物設計
5、cirRNA PCR擴增
6、PCR數據統計
只要您提供樣本及待檢測的cirRNA名稱,本公司可為您完成后續的所有實驗。

詳細聯系方式見下方
 
上海英拜生物科技有限公司
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