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鐵死亡是一種調節性細胞死亡模式，其特征是脂質過氧化的鐵依賴性積累。它與許多疾病的病理生理過程密切相關。鐵死亡的機制復雜，主要與代謝、活性氧和鐵調節有關。鐵死亡與許多生理活動有關，如腫瘤抑制、免疫反應、發育和衰老，在多種疾病中普遍起著關鍵作用。鐵死亡參與肺癌、乳腺癌、肝細胞癌、膀胱癌等的腫瘤發生、進展、轉移和耐藥性。鐵死亡在非腫瘤性疾病中也起著關鍵作用，包括神經源性疾病、傳染病、自身免疫性疾病、視網膜疾病和組織損傷。總的來說，鐵死亡是疾病診斷、治療和預后預測的新方法。

最近，廣州醫科大學附屬腦科醫院團隊發布了新版鐵死亡調節因子和疾病關系數據庫——FerrDb V2（www.zhounan.org/ferrdb/），該數據相關文章發表在Nucleic Acids Res期刊（IF:19.160）。FerrDb V2收錄了從3288篇論文中搜集到的1001個鐵死亡調節因子（264個驅動基因、238個抑制基因、9個基因標志物、110個未分類基因、201個激活劑，179個抑制劑）和143個鐵死亡——疾病相互關系。與FerrDb V1相比，覆蓋的論文數量增加了3倍，鐵死亡調節因子的數量增加了1.75倍。FerrDb V2也整合了來自公共數據庫的資源（如GTEx、TCGA、DepMap、GEN等），能更加方便的對目標基因進行多層次多角度的關聯分析。

FerrDb V2擁有全新的用戶界面、更好的交互性能、更高的數據質量，為研究人員提供了更豐富的數據資源和便捷的分析工具。首頁中具有瀏覽、基因沉默、下載、提交和聯合分析等下拉菜單選擇研究內容，也可以直接進行搜索，方便用戶選擇。

在“瀏覽”模塊中包含促鐵死亡基因、抑制鐵死亡基因、未知功能的鐵死亡調節基因、鐵死亡標志物基因、鐵死亡激動劑、鐵死亡抑制劑和鐵死亡相關疾病七個子菜單。

在“基因沉默”下拉菜單中，提供了指向CRISPR和RNAi數據集的鏈接，它們可用于查詢鐵死亡基因調節因子的gRNA和shRNA序列。

FerrDb V2 還提供了有用的在線分析分析。它們位于“聯合分析”下拉菜單中。它們可用于檢查鐵死亡基因調節因子的調控網絡，進行基因集富集分析，以查找基因相關性，以檢查 DEG 的景觀，并瀏覽具有多種作用的基因調節因子。

每個鐵死亡基因調節因子都有一個詳細信息頁面。單擊表中的基因符號（例如MTOR）將打開其詳細信息頁面。 “描述”部分顯示了有關該基因的基本信息。在“文獻來源”部分，有關該基因的研究詳細信息列在表格中，單擊條目的“查看”按鈕將顯示該基因如何通過與其他生物分子相互作用來調節鐵死亡的途徑。還可以顯示外部數據庫的基因相關數據。

在“TCGA譜”部分，提供了轉錄組和蛋白質組學譜。對于轉錄組譜，與其他基因相比，基因的RNA水平和差異基因表達。對于蛋白質組學譜，顯示了與其他基因相比該基因的蛋白質豐度。由于TCGA提供了參與者的隨訪數據，因此可以在“癌癥預后”部分進行基因對癌癥患者的生存分析。

“富集分析”實用程序可用于測試給定的基因列表是否在任何基于過度代表性或 GSEA 分析的鐵死亡調節因子集中進行統計富集。“DEG景觀”實用程序可用于同時檢查疾病中所有鐵死亡基因調節因子的整體差異表達。 “相關性分析”實用程序可用于分析兩個基因之間的相關性以及一個基因的兩個組學譜之間的相關性。

阻斷鐵死亡可能作為OA治療的替代治療策略。我們下載這些 OA DEG，按 log2 倍變化對它們進行排序，然后將它們輸入到輸入面板的“基因列表”文本區域中。我們進行了過度代表性和GSEA分析。從圖中可以看出OA DEG在鐵死亡中顯著富集。

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