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microRNA靶基因分析

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microRNA靶基因分析

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                                                  mciroRNA靶基因分析
1.通過TargetScan, Mirbase, Miranda預測microRNA靶基因。
2.三個軟件預測的前200個靶基因,兩兩之間取交集選取共同靶基因。
3.每個軟件前50個靶基因與另外兩個軟件預測的所有靶基因相比,選取共同靶基因。
4.三個軟件預測的前10個靶基因,如不在基因列表之內的,則加入列表中。
5.根據第4步得到的靶基因進行顯著性GO功能集分析和顯著性Pathway分析,將GO和Pathway所包含的靶基因取交集。

6.所得靶基因根據三個軟件總得分排序(各自得分做標準化相加)。

   




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